Klonowa hematopoeza i ryzyko zachorowania na raka spowodowane wnioskami z sekwencji DNA krwi AD 2

Traktowaliśmy pacjentów i grupę kontrolną jako pojedynczą grupę dla wszystkich analiz przedstawionych poniżej, ponieważ żadna z analizowanych zmiennych mutacyjnych nie wykazała istotnego związku z diagnozą psychiatryczną po tym, jak kontrolowaliśmy inne czynniki, takie jak wiek i palenie tytoniu. DNA ekstrahowano bezpośrednio z próbek krwi obwodowej żył. Wszystkie procedury zostały zatwierdzone przez odpowiednie komisje etyczne, a pisemna zgoda została uzyskana od wszystkich uczestników. Metody sekwencjonowania i analizy DNA zostały szczegółowo opisane w Dodatku Uzupełniającym. Identyfikacja mutacji somatycznych
Rysunek 1. Rysunek 1. Ekspansja klonalna i frakcje alleliczne. Continue reading „Klonowa hematopoeza i ryzyko zachorowania na raka spowodowane wnioskami z sekwencji DNA krwi AD 2”

Klonowa hematopoeza i ryzyko zachorowania na raka spowodowane wnioskami z sekwencji DNA krwi

Nowotwory powstają na skutek wielu nabytych mutacji, które przypuszczalnie występują przez wiele lat. Wczesne stadium rozwoju raka może być obecne na wiele lat przed wystąpieniem klinicznie oczywistych nowotworów. Metody
Przeanalizowaliśmy dane z sekwencjonowania całego egzema DNA w komórkach krwi obwodowej od 12 380 osób, niewyselekcjonowanych z powodu raka lub fenotypów hematologicznych. Zidentyfikowaliśmy mutacje somatyczne na podstawie nietypowych frakcji allelicznych. Wykorzystaliśmy dane ze szwedzkich krajowych rejestrów pacjentów, aby śledzić wyniki zdrowotne przez 2 do 7 lat po pobraniu próbek DNA.
Wyniki
Hemopoezę klonalną z mutacjami somatycznymi obserwowano u 10% osób w wieku powyżej 65 lat, ale tylko u 1% osób w wieku poniżej 50 lat. Wykrywalne ekspansje klonalne najczęściej obejmowały mutacje somatyczne w trzech genach (DNMT3A, ASXL1 i TET2), które wcześniej wiązały się z nowotworami hematologicznymi. Continue reading „Klonowa hematopoeza i ryzyko zachorowania na raka spowodowane wnioskami z sekwencji DNA krwi”

Zawierająca domenę 7 typu thrombospondyna w idiopatycznej nefropatii błoniastej AD 6

Barwienie próbki z biopsji pod kątem obecności antygenu (THSD7A lub PLA2R1) może identyfikować niewielki dodatkowy odsetek pacjentów, których surowica została pobrana z próbki po wystąpieniu remisji immunologicznej.12,15 Łącznie nefropatia błoniasta związana z THSD7A i PLA2R1 może obecnie stanowią około 75 do 85% przypadków, co dodatkowo pomaga odróżnić idiopatyczną od wtórnej nefropatii błoniastej. Pozostałe 15 do 25% przypadków może obejmować jeszcze niezidentyfikowane autoantygeny, które różnią się od THSD7A i PLA2R1 lub mogą zostać błędnie sklasyfikowane jako idiopatyczne z powodu niewykrytej wtórnej przyczyny choroby. THSD7A początkowo scharakteryzowano jako białko śródbłonkowe, które ulega ekspresji w układzie naczyniowym9. Wykazaliśmy przez analizę immunohistologiczną, że THSD7A jest skoncentrowany w podstawowym aspekcie podocytu, i nie znaleźliśmy żadnej ekspresji w kłębuszkowych komórkach śródbłonka. To odkrycie jest zgodne z ostatnimi danymi, które pokazują, że THSD7A jest silniej eksprymowany w podocytach niż w komórkach śródbłonka kłębuszkowego i mezangialnego.16 Na podstawie tych danych eksperymentalnych, naszych obecnych wyników immunohistologicznych i poprzednich danych od pacjentów z innymi postaciami nefropatii błoniastej 2,17 uważamy, że prawdopodobny mechanizm błoniastej nefropatii związanej z THSD7A obejmuje tworzenie kompleksu immunologicznego in situ z THSD7A związanym z podocytem. Nasza niezdolność do wykrywania krążących rozpuszczalnych kompleksów immunologicznych THSD7A lub THSD7A-anty-THSD7A dodatkowo potwierdza ten pogląd. Jednak nie możemy całkowicie wykluczyć obecności krążących rozpuszczalnych kompleksów immunologicznych THSD7A lub THSD7A-anty-THSD7A z powodu możliwego braku czułości naszych testów. Continue reading „Zawierająca domenę 7 typu thrombospondyna w idiopatycznej nefropatii błoniastej AD 6”

Zawierająca domenę 7 typu thrombospondyna w idiopatycznej nefropatii błoniastej AD 5

We wszystkich 5 dostępnych próbkach biopsyjnych od pacjentów z błoniastą nefropatią, którzy byli dodatni w kierunku przeciwciał anty-THSD7A, analiza immunohistochemiczna wykazała znacznie zwiększone wybarwianie granulek dla THSD7A (Figura 5C); Barwienie PLA2R1 było prawidłowe u tych pacjentów (Figura 5D). Przeciwnie, wszyscy pacjenci z wykrywalnymi przeciwciałami surowicy anty-PLA2R1 mieli normalne wybarwianie THSD7A wzdłuż ścian naczyń włosowatych (Figura 5E), ale zwiększone barwienie granularne dla PLA2R1 (Figura 5F), jak opisano wcześniej.10-12 Trzech z tych pacjentów miało skąpe i Niespecyficzny wynik dla THSD7A w materiale białkowym w przestrzeni otoczkowej kilku kłębuszków (dane nie przedstawione). Wszystkie 50 próbek pobranych od pacjentów z nefropatią błoniastą i bez wykrywalnych autoprzeciwciał miało prawidłowe wybarwienie zarówno dla THSD7A, jak i PLA2R1 (Figura 5G i 5H). Wiadomo, że antygen PLA2R1 kolokalizuje się z IgG4 w złogach podnabłonkowych u pacjentów z idopatyczną nefropatią błoniastą związaną z PLA2R1.2 Podobnie, stwierdziliśmy kolokalizację IgG4 i THSD7A w próbkach biopsyjnych od pacjentów seropozytywnych THSD7A (ryc. S9 w dodatku uzupełniającym). Co więcej, odkryliśmy lokalną aktywację dopełniacza, co pokazuje silne ziarninowe barwienie dla C5b-9 (ryc. S10 w dodatkowym dodatku). Continue reading „Zawierająca domenę 7 typu thrombospondyna w idiopatycznej nefropatii błoniastej AD 5”